亚洲天码中文字幕永久在线_午夜影院亚洲_久久久黄色视频无码_四虎欧美永久在线精品免费_一级情趣社区大地影视久久一区_在线欧美成人资源_国产91美女高潮在线观看_中文字幕三级片亚洲_日韩色色com亚洲免费日_无码国产精成人午夜视频

1、甲基化測序種類

1、WGBS甲基化測序（全基因組甲基化測序）

2、RRBS甲基化測序

3、MeDIP甲基化測序

4、Human靶向甲基化測序

5、mRNA甲基化測序

2、各類甲基化測序的優(yōu)勢

1、WGBS甲基化測序（全基因組甲基化測序）

1） 全基因組范圍內(nèi)定量的分析甲基化位點

2） 單堿基分辨率

3） Bisulfite的轉化效率達99％以上

2、RRBS甲基化測序

1） 直接針對酶切富集啟動子區(qū)域以及CpG島區(qū)域進行甲基化研究

2）DNA甲基化狀態(tài)檢測的高分辨率和測序數(shù)據(jù)的高利用率，有效增加了測序深度。

3）可以與單細胞測序技術結合，進行細胞細胞RRBS測序

3、MeDIP甲基化測序

1） 全轉錄組范圍研究mRNA的甲基化位點

2） 通過抗體富集的方法，充分利用了抗體的靈敏性

3） 分析方法類似ChIP-seq，數(shù)據(jù)分析相對成熟

4、Human靶向甲基化測序

安捷倫SureSelect靶向序列捕獲試劑盒優(yōu)勢

? 探針設計：cRNA探針長度>120bp，更有效捕獲變異序列，比DNA探針更有效捕獲DNA目標序列；僅需24小時雜交，3 μg起始量gDNA，將PCR所需循環(huán)數(shù)降至最低。

? 檢測精度高：單堿基分辨率，精確分析每一個C堿基的甲基化狀態(tài)。

? 效率高，耗時少：借助新一代高通量測序平臺可檢測除CpG島外的shore and shelf ±4kb的范圍區(qū)域，穩(wěn)定可靠的液相靶向捕獲測序技術。

羅氏SeqCap Epi甲基化富集試劑盒技術優(yōu)勢：

? 實驗流程：先重亞硫酸鹽處理后捕獲，捕獲后多樣性高，重復性好。

? 探針生產(chǎn)：針對區(qū)段各種甲基化情況獨立設計的探針確保所有甲基化位點的有效捕獲。

? 雙鏈捕獲：與單鏈捕獲相比雙鏈捕獲能提供多態(tài)性信息，提高甲基化分析的正確性。

? 定制設計：更關注于感興趣的區(qū)域（DMR），或者非人類的甲基化，更多收獲需要更少的樣本起始量，低至1ug。

捕獲試劑盒產(chǎn)品規(guī)格：

1. 目錄產(chǎn)品

SureSelectXT Human Methyl-Seq（84M 區(qū)域）

捕獲的區(qū)域通常包括CpG島，Ensemble數(shù)據(jù)庫中的調(diào)控元件，癌癥組織特異的DMRs，ENCODE promoters，DNAsel超敏感位點，參考基因等。

SeqCap Epi CpGiant（80.5M區(qū)域）

包含了Illumina Infinium Human Mthylation 450K的所有甲基化位點及其附近的區(qū)域，覆蓋了人類基因組上大于5.5 million個CpG位點。

2. 定制產(chǎn)品

安捷倫定制甲基化捕獲區(qū)域分別有：（16個樣本起訂）1k-499k、0.5M-2.9M、3M-5.9M、6M-11.9M、 12M-24M

羅氏定制甲基化捕獲區(qū)域有：

SeqCap Epi Choice Enrichment Kits（人類特定基因組定制設計）：小區(qū)域（ <30M），中等區(qū)域（30-60M），大區(qū)域（60-90M）；包裝數(shù)：4,48,384

SeqCap Epi Developer Enrichment Kits（非人特定基因組定制以及超大區(qū)域的人類基因組）：小區(qū)域（ <30M），中等區(qū)域（30-60M），大區(qū)域（60-90M），超大區(qū)域（90-210M）；包裝數(shù)：12,48,384

5、mRNA甲基化測序

表觀遺傳修飾不僅發(fā)生在基因組層面（DNA甲基化），同樣在轉錄組層面也有表觀修飾，并且其中重要的轉錄后調(diào)控功能。早在四十年前，人們就發(fā)現(xiàn)信使RNA上存在著腺嘌呤上的甲基化修飾（m6A）。這種m6A修飾非常普遍，出現(xiàn)頻率大約是3-5個殘基/mRNA。m6A甲基化修飾是可逆的，而且可能受到了動態(tài)調(diào)控。m6A的甲基化和去甲基化受到甲基化酶復合體METLE3，METLE14，WTAP和去甲基化酶FTO調(diào)控。m6A在人類和小鼠的轉錄組中非常保守，這說明這種修飾很可能具有重要的功能。m6A與mRNA剪切，生物鐘調(diào)節(jié)，mRNA的穩(wěn)定性相關。此外，m6A通過招募YTHDF2誘導mRNA從翻譯中的核糖體轉移到細胞質(zhì)的P-body，并在那里被降解。而且mRNA的降解程度與其甲基化位點數(shù)有關。

對于mRNA甲基化的檢測，目前采用：甲基化mRNA富集并結合高通量測序（MeRIP-Seq, m6A-specificmethylated RNA immunoprecipitation with nextgenerationsequencing）的方法。MeRIP -Seq的原理是：由于在哺乳動物中mRNA甲基化一般發(fā)生在腺嘌呤的第6位氮原子上，所以可通過特異性結合m6A抗體富集高甲基化的mRNA片段，并結合第二代高通量測序，對富集到的mRNA片段進行測序，從而檢測全轉錄組范圍內(nèi)的甲基化位點。