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1、技術(shù)介紹
NGS可以獲得大量的測序數(shù)據(jù)但是由于讀長較短，無法直觀的看到整個基因組范圍的結(jié)構(gòu)變化，而且由于基因組的復雜性（重復序列和結(jié)構(gòu)變異）限制了基因組的重構(gòu)和對功能原件的理解。因此迫切需要針對更長片段的分析方法。BioNano公司利用其專利的芯片技術(shù)開發(fā)的Irys系統(tǒng)可以對長鏈DNA單分子成像，在更短時間提供更完整的基因組光學圖譜。
Irys系統(tǒng)特點
1. 長鏈DNA分子 — 可檢測長達幾百kb的長鏈DNA分子，很好解決重復序列和可變區(qū)對研究帶來的影響。
2. 高質(zhì)量的數(shù)據(jù) — 單分子DNA通過納米通道被拉直平行排列，利用高質(zhì)量圖像使基因組結(jié)構(gòu)展現(xiàn)無遺。
3. 應(yīng)用靈活 — 開放性的平臺適合研究人員進行多個領(lǐng)域的研究，尤其在de novo和染色體結(jié)構(gòu)變異方面提供了全新的研究方法。
晶能優(yōu)勢
1） BioNano公司的Irys平臺，有著通量大，準確性高等特點，在光學圖譜質(zhì)量和性價比上高于其他光學圖譜類平臺。
2） 已完成多項動植物光學圖譜構(gòu)建，有著豐富的輔助NGS數(shù)據(jù)再拼接的實驗和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗
2、技術(shù)路線
3、樣品要求
1） 樣品濃度：最低濃度40ng/μl～200ng/μl。
2） 樣品總量：每個樣品總量不少于10μg。
3） 樣品溶劑：基因組完整（大于等于150kb）、無污染。
4） 樣品運輸：DNA低溫運輸（4℃）；且在運輸過程中請用parafilm將管口密封以防出現(xiàn)污染